Hi-Meth：特定位点DNA甲基化高通量检测平台

摘要

胞嘧啶甲基化是DNA表观遗传修饰的主要类型之一，在维持正常细胞功能和调控基因表达中具有重要作用。重亚硫酸盐测序法（bisulfitesequencingPCR,BSP）是特异性位点DNA甲基化检测的通用方法，能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态，但此方法需要大量的单克隆测序，操作过程较繁琐、成本昂贵。因此，开发准确、高效、便捷的DNA甲基化检测技术对提升表观遗传研究效率具有重要意义。基于本课题组开发的高通量突变类型检测平台Hi-TOM（high-throughputtrackingofmutations），我们进一步建立了特定位点DNA甲基化高通量检测平台Hi-Meth （high-throughput detection of DNA methylation）。DNA样品通过重亚硫酸盐处理之后，仅需一轮PCR扩增即可通过Hi-Meth平台获得特定位点DNA甲基化分析结果。利用Hi-Meth平台，对水稻不同基因启动子区域进行了DNA甲基化检测分析，并与基于BSP方法获得的结果进行了比较。结果表明，Hi-Meth策略与BSP策略检测结果基本一致。而且通过Hi-Meth平台可以更准确、便捷地获得特异性位点DNA甲基化分析结果。综上所述，Hi-Meth为特定DNA区域提供了重要的甲基化检测平台，对表观遗传研究具有重要意义。