鸡Foxp3结构预测及组织表达谱分析

摘要

本研究旨在克隆鸡foxp3 （chfoxp3）基因全长编码区序列（coding sequence, CDS），并对其进行生物信息学及组织表达谱分析。以50日龄无特定病原鸡为样本，从脾脏组织中克隆chfoxp3基因全长CDS序列，利用在线工具和软件对chFoxp3进行生物信息学分析，以实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR, qRT-PCR）技术检测chfoxp3基因在鸡各组织中的表达分布情况。研究结果表明，chfoxp3基因包含882 bp的开放阅读框，编码293个氨基酸，chFoxp3分子质量为33.44 kDa，属于亲水蛋白；chFoxp3具有Fox转录因子家族典型的forkhead结构域，含有核定位信号；其二级结构由α-螺旋（29.35%）、延伸链（10.92%）、β-转角（5.12%）和无规则卷曲（54.61%）组成；chfoxp3在不同组织中表达有差异，在鸡心脏及胰腺中表达水平较高，显著高于脾脏、法氏囊以及胸腺等免疫器官（P＜0.01），这一特点明显区别于哺乳动物；通过系统进化树分析发现，鸡Foxp3与其他野禽属于相同分支，但与哺乳动物相差较远。这些研究结果为进一步深入研究chFoxp3的免疫调节功能奠定了基础。