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小鼠APOBEC3的结构与功能分析

         

摘要

随着对APOBEC3抗病毒功能的深入研究以及其在癌症中的表现,APOBEC3已成为当前的热点.小鼠只有一个APOBEC3基因,而人类有七个APOBEC3基因,人类APOBEC3G是其中研究最明确的抗病毒蛋白.利用生物信息学方法对两个蛋白进行序列比对、亲疏水性分析、亚细胞定位预测、二级结构及高级结构分析以及相互作用分析.结果显示小鼠APO-BEC3和人类APOBEC3G具有很多相似之处,二者均为碱性的不稳定亲水性蛋白质,二者含量最高的氨基酸也都是Leu.小鼠APOBEC3属于APOBEC超家族,具有两个保守的结构域.小鼠APOEC3的结构分析可能对进一步揭示哺乳动物APO-BEC3的功能具有重要意义.

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