大鼠颅脑损伤后差异表达基因及miRNA研究

摘要

研究背景创伤性脑损伤(Traumatic brain injury,TBI)是致死率和致残率极高的外科疾患,我国在对于TBI的判断、治疗等方面还处于薄弱阶段,因此我们需要在分子层面了解大鼠颅脑损伤后基因及miRNA表达差异,以便更好地对症治疗.目的了解大鼠颅脑损伤后基因及miRNA表达差异,为临床治疗TBI提供新的思路.方法利用GEO2R筛选基因,然后用MiR-walk软件对筛选的miRNA的靶基因进行预测,再用DAVID做基因本体论功能富集分析,最后利用cytoscape做网络关系图.结果发现247个相对明显的差异表达的基因,包括150个上调表达基因和97个下调表达基因;7个差异表达的miRNA,包括2个上调表达miRNA和5个下调表达miRNA.这些差异表达基因在细胞内和细胞外都起作用,并且在炎症反应,药物应答等生物过程中起作用.将差异基因与靶基因对比后,可得到48个重合基因,同时发现这些重合基因与差异表达的miRNA有着一定的联系.