冬季不同饲养模式下哈萨克马肠道菌群多样性研究

摘要

不同饲养模式对哈萨克马肠道菌群有何影响鲜有报道,本文通过对比自由放牧和圈养状态下哈萨克马粪便菌群组成和标志物种,揭示哈萨克马肠道菌群在不同饲养模式下的波动性变化。采集自由放牧和圈养条件下各5匹哈萨克马的新鲜粪便,利用高通量测序技术分析哈萨克马肠道菌群组成、功能途径等。结果显示,放牧组肠道菌群多样性显著高于圈养组(Shannon指数,P<0.05;Simpson指数,P<0.01);放牧组标志物种显著多于圈养组。在门水平上,放牧组和圈养组的厚壁菌门(76.10%;78.08%)和拟杆菌门(17.16%;15.72%)丰度较高,均占总菌群的93%以上。在科水平上,放牧组以分解/发酵纤维素的菌群(瘤胃球菌科,30.44%;毛螺菌科,21.96%;艰难杆菌科,4.86%)为主;圈养组中分解/发酵纤维素的瘤胃球菌科(28.73%)和毛螺菌科(14.51%)以及消化淀粉类碳水化合物的链球菌科(15.08%)为优势菌科,且链球菌科的丰度显著高于放牧组(P<0.05)。对功能基因序列进行功能注释时,77.44%的序列被注释为“代谢”。结果表明,由不同饲养模式介导的两组中,自由放牧组菌群多样性高于圈养组,且菌群消化类型更为统一,两组肠道菌群组成存在整体性差异,这些为进一步研究哈萨克马肠道菌群奠定了理论基础。