饲粮中添加共轭亚油酸对猪肌肉组织miRNA表达谱的影响

摘要

旨在探讨共轭亚油酸(CLA)通过影响猪肌肉miRNA表达调控肌肉代谢的分子机制.本研究选用体重相近的初产荣昌母猪12头,随机分为对照组和CLA组,CLA组母猪饲粮从妊娠初期开始添加1.5％ CLA,持续到仔猪28日龄断奶;断奶后分别从对照组和CLA组挑选仔猪各30头,原CLA组仔猪饲粮中继续添加1.5％ CLA.待仔猪体重约30 kg时,每组各选择6头进行屠宰,采集背最长肌和腿肌样品.提取RNA后将对照组和CLA组的背肌和腿肌进行建库;通过Solexa高通量测序技术检测CLA对猪肌肉组织miRNA表达谱的影响,利用生物信息学进行差异显著表达miRNA的靶基因预测和功能分析.结果显示:1)背肌和腿肌分别获得了44 869 982条和45 105 806条clean reads,大多数序列长度在20～23 nt.2)背肌和腿肌分别鉴定到306和304个已知miRNAs,有295个miRNAs共表达.3)添加CLA后能改变猪肌肉中miRNA的表达,分析表明,CLA对腿肌miRNA表达的影响要强于背肌;背肌和腿肌中分别发现5个和12个差异显著表达的miRNAs(P＜0.05),其中ssc-miR-224在两种组织中都差异表达,因此共有16个差异表达miRNAs.4)对16个差异表达miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路富集分析,发现它们的靶基因主要富集于292个通路,其中24个通路显著富集(P＜0.05),包括与肌肉代谢密切相关的MAPK信号通路和Notch信号通路.5)利用荧光定量PCR对随机选择的6个差异表达miRNAs进行验证,证实其表达水平和测序结果基本一致.以上结果说踢,CLA可能通过影响肌肉miRNA表达,调控重要肌肉代谢通路.