口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析

摘要

以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板,用一对特异性引物扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy 载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定.序列测定和分析结果表明,该强毒株与A12、O1K和TW45毒株的核苷酸差异率分别为7.78%、6.62%和13.19%.推导的氨基酸序列差异率分别为1.23%、1.84%和5.73%.4个毒株序列比较发现,China/99、O1K和TW45三毒株的2A/2B连接处为甘氨酸/脯氨酸,A12为精氨酸/脯氨酸,而且T-C转换率和A-G转换率较高,是点突变的热点核苷酸.氨基酸差异主要存在于2B和2C蛋白中,2A基因较为保守.2B蛋白的第1-4,63-67,73-78,83-91,116-121和126-131区域,2A蛋白的第4-9区域和2C蛋白的第9-13,22-25,91-96,150-159,179-188,201-207和258-262区域可能是重要的活性中心.