金川多肋牦牛Hoxa6和Hoxa10基因甲基化与mRNA差异表达研究

摘要

本研究旨在通过检测金川多肋牦牛与普通牦牛中Hoxa6和Hoxa10基因的转录水平和启动子区甲基化状态,为揭示Hox基因在金川多肋牦牛多1对肋骨性状形成中的转录调控机制奠定基础.通过实时荧光定量PCR技术检测Hoxa6和Hoxa 10基因在多肋牦牛和普通牦牛中的mRNA表达水平,同时采用重亚硫酸盐测序PCR(Bisulfite-sequencing PCR,BSP)法对Hoxa6和Hoxa 10启动子区进行甲基化修饰与克隆测序,分析甲基化状态.结果显示,多肋牦牛中Hoxa6基因表达量显著高于普通牦牛(P＜0.05),而Hoxa10基因表达量显著低于普通牦牛(P＜0.05).Hoxa6启动子区域的CpG2,在普通牦牛中的DNA甲基化显著高于多肋牦牛(P＜0.05),尤其是第3、4、8、20和21位CpG位点;Hoxa10启动子区域的CpG1在普通牦牛中的DNA甲基化状态显著低于多肋牦牛(P＜0.05),普通牦牛的第9和12位CpG位点几乎未甲基化.多肋牦牛中Hoxa10高甲基化在一定程度上抑制了Hoxa10基因的表达,Hoxa6低甲基化水平促进了Hoxa6基因的表达.启动子区域的甲基化在一定程度上影响Hox基因的转录调控,且与多肋性状的形成可能存在一定的联系.