鉴别参与调控长白猪脂肪沉积的重要基因和lncRNA

摘要

脂肪沉积与生猪生产效率、猪肉品质和繁殖性状密切相关,猪脂肪沉积的调控机制一直是研究热点,且研究多基于脂肪和肌肉组织。本研究以极端背膘厚的长白猪的肝脏组织为研究样本,进行转录组测序,并鉴定长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),之后进行差异mRNA和lncRNA表达分析。通过生物信息学分析筛选出ACAA1、ACLY、APOA4、CRABP1、ELOVL6、FASN、HMGCR、PCK1、SQLE9个可能参与脂肪沉积调控的候选基因。根据lncRNA与mRNA之间的位置关系和表达相关预测它们之间顺式和反式调节方式,并构建两者间的调控网络,发现8个lncRNA参与调控ACAA1、ACLY、CRABP1、ELOVL6、FASN、HMGCR、PCK17个候选基因。该研究结果为脂肪沉积相关的lncRNA的发现和注释提供了新的见解,并为进一步阐明猪脂肪沉积的分子调控机制奠定基础。