基于RNA-seq筛选不同饲养模式下肉鸡肌肉发育代谢相关差异基因

摘要

cqvip:为发掘饲养模式影响肌肉发育代谢的相关关键基因,本研究分别在笼养和地面平养2种饲养模式中随机选取5只42日龄Ross 308肉鸡进行屠宰,提取腿肌RNA,通过RNA-seq技术筛选出与肌肉发育代谢相关的差异基因,并利用qPCR进行验证。随后分离、鉴定并构建了鸡骨骼肌卫星细胞增殖分化模型,对关键差异基因PHGDH在鸡骨骼肌细胞中的表达模式进行检测。结果显示:在2种饲养模式中共筛选出3个差异表达基因(ASNS、JPH2、PHGDH),qPCR验证结果与RNA-Seq测序结果一致,差异基因均在平养模式鸡腿肌肌肉中高表达;在鸡骨骼肌细胞增殖期间,PHGDH表达逐渐上调,但在分化第2天至第6天,表达水平逐渐下降;EdU细胞增殖检测结果显示,抑制PHGDH的表达可显著抑制鸡骨骼肌细胞的增殖。以上结果表明,PHGDH可能在鸡骨骼肌形成过程中发挥重要作用。