基于转录组分析不同硒源调节黄颡鱼适应低温应激的信号通路及关键基因

摘要

本试验基于转录组测序和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术研究亚硒酸钠和酵母硒对低温(13°C)应激下黄颡鱼肝脏转录组和关键基因表达的影响,以期探讨不同硒源调节黄颡鱼适应低温应激的信号通路及关键基因.以5.7 g左右的黄颡鱼为研究对象,分别投喂添加亚硒酸钠(T1组)和酵母硒(T2组)的试验饲料,于养殖42 d后开展低温应激试验.结果显示:T2组黄颡鱼的增重率和存活率高于T1组,但差异不显著(P>0.05).与亚硒酸钠相比,酵母硒显著提高了低温应激后黄颡鱼血清甘油三酯含量及抑制与产生超氧阴离子自由基能力(P<0.05),并显著降低了血清丙二醛含量(P<0.05).肝脏转录组分析显示,T1组和T2组分别产生了140574638和139455508个高质量reads(clean reads),共筛选到147个差异表达基因,其中76个基因表达量上调,71个基因表达量下调,表达上调基因显著富集到蛋白质水解作用、水解酶活性、肽酶活性、肽链内切酶活性、羧肽酶活性、蛋白质代谢过程以及胰腺分泌、蛋白质消化与吸收、脂肪消化与吸收、花生四烯酸代谢、醚脂代谢等通路.这些通路中的硒蛋白M、磷脂酶A2、羧肽酶A1、类胰蛋白酶-1、胰凝乳蛋白酶样弹性蛋白酶家族成员2A等关键基因的表达量显著上调.通过RT-qPCR对上述差异表达基因进行验证,证实了转录组测序结果的可靠性.综上所述,摄食酵母硒为硒源饲料的黄颡鱼的生长性能、抗低温能力优于摄食亚硒酸钠为硒源饲料的黄颡鱼,酵母硒可能通过上调胰腺分泌、蛋白质消化与吸收、脂肪消化与吸收、花生四烯酸代谢、醚脂代谢等通路关键基因的表达提高黄颡鱼的抗低温应激的能力.