传染性支气管炎病毒疫苗株H52的全基因组克隆与分析

摘要

采用RT-PCR方法克隆测定传染性支气管炎病毒(Infections Bronchitis Virus,IBV)疫苗株H52全基因组序列,并与其它已知全基因组序列的我国分离株进行比较分析,以分析我国IBV地方分离株与疫苗株的分子遗传关系.结果表明,H52基因组全长为27 630 bp(不包括polyA),A+T含量为61.8%,它与我国IBV分离株全基因组同源性在83.9%～95.2%之间,其中与KQ6的同源性最高(95.2%),与其余株均在88%以下.在基因组内基因的同源性中,以S1、S2与E变异最大,除KQ6外,其余各株(含台湾株)与H52在S1蛋白上的同源性只有72.4%～80.7%,在S2蛋白上的同源性为85.5%～88.1%,E蛋白为82.9%～93.3%.系统进化分析表明,国内分离株,除KQ6外,在进化分支中已独立于H52和其它Massachusetts型衍生毒株.H52与我国地方分离株存在较大的分子遗传差异,这些差异可能导致单纯Massachusetts型疫苗(如H120,H52)不能有效地免疫保护我国的鸡群.