肺表面活性蛋白A适配体的筛选与鉴定

摘要

利用指数式富集的配基系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术筛选肺表面活性蛋白A(Pulmonary Surfactant Protein A,SP-A)的寡核苷酸适配体.通过对循环次数、退火温度及引物比例的优化,建立了适合的筛选体系;筛选产物经克隆测序后,用DNAMAN软件初步分析其结构.最终确定以12个循环,55℃为退火温度及80∶1为引物比的反应条件;经过9轮循环筛选,随机ssDNA库与SP-A的结合率从1.3％上升到33％;AP-3和AP-2适配体的随机区含有保守序列TAC-GT,AP-3和AP-1适配体的随机区含有保守序列ACAG,且各适配体的二级结构均以茎-环结构为主.