基于多组学数据分析复制因子C4在肝细胞癌中的表达及预后

摘要

目的 探讨复制因子C4(RFC4)作为肝细胞癌(HCC)潜在的预后标志物及其临床意义.方法 使用基因表达谱分析(GEPIA)、Oncomine、UALCAN、人类蛋白图谱数据库和Kaplan-Meier plotter网站,分析RFC4 mRNA和蛋白在HCC中的表达,探讨其表达水平与HCC临床病理特征和预后的关系.通过cBioPortal网站分析HCC中RFC4的基因突变、拷贝数变异、mRNA表达及与预后的关系.利用String、Metascape数据库和Cytoscape软件对共表达基因和蛋白间的相互作用进行分析及可视化处理,并预测其生物学功能.结果 与正常组织相比,RFC4 mRNA在HCC中显著高表达(P=4.58×10-8),同时发现RFC4 mRNA的表达水平与HCC的淋巴结转移、肿瘤分期及病理分级有关(P<0.05).生存分析结果显示,相比RFC4 mRNA低表达组,RFC4 mRNA高表达组患者的总生存时间(HR=1.81,95％CI:1.26～2.59;P=0.001)、无进展生存时间(HR=1.65,95％CI:1.20～2.26;P=0.0019)及无复发生存时间(HR=1.70,95％CI:1.19～2.42;P=0.0029)均显著缩短.相比无RFC4基因改变组,RFC4基因变异组患者的预后更差(P<0.05).富集分析结果显示,RFC4与其相关表达基因主要参与细胞周期、细胞分裂、DNA复制和修复等生物学过程.结论 HCC中RFC4过度表达与预后相关,其可能是HCC潜在的预后生物标志物.