冠心病患者血浆环状RNA表达谱分析

摘要

目的 探讨冠心病(冠状动脉粥样硬化性心脏病)患者血浆环状RNA的表达谱及其作为冠心病诊断标志物的潜在价值.方法 选取2016年9-12月在首都医科大学附属北京安贞医院心内科住院拟诊为冠心病的6例患者为研究对象.根据冠状动脉造影结果分为冠心病组和对照组,各3例.提取血浆总RNA,采用环状RNA芯片筛选2组血浆样本中差异表达的环状RNA.运用生物信息学分析对环状RNA可能结合的微小RNA(miRNA)及其可能参与的分子通路进行预测.结果 环状RNA芯片数据显示,与对照组比较,冠心病组血浆中有116个环状RNA呈现差异性表达,其中74个表达上调,42个表达下调(差异表达倍数＞1.2,P＜0.05).对与这些差异表达环状RNA结合匹配值较高的5个miRNA位点进行预测,最可能与hsa_circ_0007059结合的5个miRNA位点包括miR-23a-3p、miR-6818-3p、miR-23b-3p、miR-6761-5p和miR-4740-3p.GO富集分析结果发现,hsa_circ_0007059与线粒体组织负调控、丝/苏氨酸蛋白激酶抑制物活性、DNA结合等关系密切.KEGG分析表明hsa_circ_ 0007059显著富集的分子路径包括甘露糖型0-聚糖生物合成、鞘糖脂生物合成、脂肪酸延伸、嘌呤代谢等.结论 与对照组比较,冠心病患者血浆环状RNA表达谱存在明显差异.hsa_circ_0007059可能与心血管疾病的发生发展有关.