基于DNA条形码技术对草莓丝核菌属病原菌的鉴定

摘要

为了解草莓根腐病是因感染何种病原菌,并筛选最佳的基因序列对根腐病丝核菌属两个菌种的真菌进行基因检测鉴定。本文以从不同寄主分离获得的2种19株丝核菌为材料,选择ITS、CAL和GAPDH作为候选鉴定基因,评价指标包括获得序列的难易程度以及种内与种间遗传距离频率分布,研究测序获得的有效基因序列,作为筛选出的丝核菌属DNA条形码。3个基因中ITS基因的PCR扩增与测序成功率分别是100.0%和92.7%,该基因的序列片段更易获得,而其余2个基因引物PCR扩增率很低。种内与种间遗传距离重叠部分较少,种内差异明显小于种间差异,能更好地区分丝核菌属不同菌种;通过ITS基因序列构建的系统发育树显示,相同菌种聚集在同一分支,不同菌种划分在不同分支,鉴别能力较好,表明ITS基因可作为丝核菌属鉴定的DNA条形码。利用DNA条形码技术筛选出一个较短的标准DNA序列鉴定出某一个属内的物种,目前成为病原真菌快速鉴定手段。