冬夏两季水牛乳中细菌多样性的比较分析

摘要

利用16S rDNA高通量测序研究冬夏两季水牛乳中的细菌多样性.提取当天采集的生水牛乳样本的细菌总DNA,PCR扩增其16S rDNA,采用Miseq PE300平台进行高通量测序以及BLAST比对.结果冬季组样本共得到19个细菌门,92个目,456个属和733个种.而夏季组样本共得到14个门,63个目,274个和424个菌种.冬季组中的细菌多样性显著高于夏季组.夏季组中的优势菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、乳球菌属(Lactococcus)、金黄杆菌属(Chryseobacterium),而冬季组的优势菌属则为芽孢杆菌属(Bacillus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、库特氏菌属(Kurthia)、土地杆菌属(Pedobacter).样本层级聚类显示:夏季组与冬季组组间群落差异不显著.PCA与PLS-DA分析表明:冬夏两季样本组组间菌群结构差异显著.得出结论季节因素对水牛乳中细菌多样性影响较大,在湿热的夏季,乳球菌属(Lactococcus)、金黄杆菌属(Chryseobacterium)占优势,而在低温干燥的冬季,芽孢杆菌属(Bacillus)、棒杆菌属(Corynebacteri-um)、库特氏菌属(Kurthia)则占优势.冬夏两季水牛乳样本整体呈现较丰富的多样性,且冬季组中的细菌多样性明显高于夏季组.