藏羊BMPRⅡ基因多态性及其单倍型与产羔性状相关分析

摘要

【目的】研究骨形态发生蛋白受体Ⅱ(bone morphogenetic protein receptorⅡ,BMPRⅡ)基因多态性及其单倍型与藏羊产羔性状的相关性。【方法】以433只藏羊母羊为研究对象,采用改良多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction,iMLDR)对BMPRⅡ基因9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点在藏羊群体中的多态性进行检测,使用Haploview 4.2软件分析其连锁不平衡性并构建单倍型,应用基因关联分析探究BMPRⅡ基因多态性及单倍型与藏羊产羔性状的关联。【结果】藏羊BMPRⅡ基因外显子12中存在6个SNPs,分别为:g.90192 T>C、g.142532 C>T、g.142614 A>G、g.142751 T>C、g.143138 A>G和g.143189 G>A,外显子3、9和13中各存在1个SNP,分别为:g.143570 C>G、g.124843 A>C和g.145233 A>G,这9个SNPs均为同义突变。9个SNPs中,除g.90192 T>C外,均存在3种基因型。多态信息含量分析显示,群体在g.90192 T>C、g.142614 A>G和g.145233 A>G位点处于低度多态(PICC、g.142532 C>T、g.142751 T>C、g.143138 A>G、g.143189 G>A和g.143570 C>G位点均处于中度多态(0.250.05),但g.142532 C>T位点CT基因型平均产羔数高于CC和TT基因型,g.142751 T>C位点CC基因型平均产羔数高于TT和TC基因型,g.143189 G>A位点GA基因型平均产羔数高于GG和AA基因型,g.143570 C>G位点CG基因型平均产羔数高于CC和GG基因型,g.145233 A>G位点GG基因型平均产羔数高于AA和AG基因型,差异均不显著(P>0.05)。BMPRⅡ基因中除g.90192 T>C位点外的8个SNPs位点在藏羊群体中共形成14种单倍型(H1~H14),单倍型与藏羊产羔数间均无显著相关(P>0.05)。【结论】BMPRⅡ基因g.142532 C>T、g.142751 T>C、g.143189 G>A、g.143570 C>G和g.145233 A>G位点对藏羊产羔数有一定潜在的影响。