4个绵羊品种LHCGR基因单核苷酸多态性分析

摘要

为探究绵羊LHCGR基因在4个绵羊品种之间的多态性与基因功能,本研究以杜泊羊、滩羊、小尾寒羊、滩羊和小尾寒羊杂交羊4个绵羊品种为研究对象,利用Sequenom MassARRAY? SNP技术对4个绵羊品种LHCGR基因g.75747421 A＞C、g.75748200T＞A 2个位点进行检测,并利用相关生物信息学软件预测分析2个位点突变前后mRNA二级结构与其编码蛋白的理化性质、结构和蛋白互作等.结果表明,LHCGR基因g.75747421A＞C位点在4个品种中存在3种基因型,分别是CC、CA和AA;g.75748200T＞A位点在4个品种中存在AA、AT和TT 3种基因型;x2适合性检验表明,g.75747421A＞C、g.75748200T＞A 2个位点在4个绵羊品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).生物信息学分析表明,该基因编码蛋白的相对分子质量为73 599.70,理论等电点为8.30,脂肪系数为98.90,总平均亲水性为0.191,推测该蛋白为疏水性蛋白;突变前后LHCGR基因的mRNA二级结构、编码蛋白二级结构及三级结构均发生了变化;蛋白互作的结果表明,与LHCGR蛋白相互作用的蛋白质主要包括骨形态发生蛋白15(BMP15)、嗜铬粒蛋白A(CGA)、甲羟戊酸激酶(MVK)、胆固醇侧链裂解酶(CYP11A1)、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基(GNAS)等.本研究成功筛选出4个绵羊品种LHCGR基因多态位点,为绵羊繁殖力的标记辅助选择和育种提供一定的理论依据.