鲤鱼肿瘤坏死因子受体相关因子6全长cDNA克隆及序列分析

摘要

本试验以鲤鱼外周血白细胞肿瘤坏死因子受体相关因子6 (tumor necrosis factor receptor-associated factor 6,TRAF6) EST序列为基础,经地高辛标记后作为探针,对有丝分裂原刺激的鲤鱼外周血白细胞cDNA文库进行核酸杂交筛选,从重组噬菌体中经过两轮筛选获得阳性克隆.序列分析结果显示,该序列包含有5'-非编码区(5'-UTR)25 bp;3'-非编码区(3'-UTR) 535 bp,存在2个mRNA不稳定基序ATTTA;开放阅读框ORF长1632 bp,编码543个氨基酸.预测蛋白质等电点为5.88,分子质量大小为61.773 ku.序列同源性比对结果表明,所获得的序列与GenBank上登录的鲤鱼TRAF6a基因同源性达99％.蛋白质序列分析结果发现,其具有TRAF家族的典型序列特征.