玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析

摘要

为研究小分子量三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)结合蛋白的分子功能,利用RT-PCR技术克隆玉米Rab6A基因的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,该基因cDNA全长1 044 bp,包含1个660 bp的开放阅读框,编码219个氨基酸.ZmRab6A基因含有6个外显子和5个内含子,全长2 650 bp.ZmRab6A蛋白的分子量为24.39 ku,理论等电点为5.58,属于亲水性不稳定蛋白,不存在跨膜区域和信号肽,二级结构多为无规卷曲和α-螺旋.系统进化分析表明,玉米ZmRab6A与高粱的亲缘关系最近.