浮游动物DNA宏条形码标志基因比较研究

摘要

DNA宏条形码技术作为一种新型生物监测方法,在未来生态环境监测中有巨大的应用潜力.目前,浮游动物DNA宏条形码监测仍在发展阶段,需要首先对其(采样方法、引物选择和数据分析等)进行标准化和调整,然后才能用于常规流域生态监测.其中,如何选择合适的PCR扩增引物是DNA宏条形码生物监测标准化的关键问题之一.本研究比较了COI、18SV9和16S通用引物在浮游动物DNA宏条形码监测中的差异,为初步建立规范化的浮游动物DNA宏条形码监测方法提供技术支撑.结果表明,16S引物对浮游动物具有更好的特异性,其产生的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)有88.1％属于浮游动物.虽然18SV9引物具有更高的物种覆盖度,不仅能扩增出浮游动物,还能扩增出大量藻类和真菌,但其物种识别敏感性较差,不适合浮游动物物种水平多样性监测.COI引物的浮游动物物种特异性、物种覆盖度和物种识别敏感性都适中,检出的浮游动物物种数量高于18SV9引物和16S引物,更加适合浮游动物DNA宏条形码监测.