虎纹蛙病毒的ATP酶基因克隆和序列分析

摘要

利用对应于蛙病毒-3型(FV3)ATP酶基因(ATPase)的162-178 nt和1 186-1 174nt碱基序列作为引物,采用PCR方法扩增得到虎纹蛙病毒(RTV)的ATP酶基因,并对该基因进行克隆、测序和分析.基因读码框大小为945bp,预计可编码一相对分子质量为35 500的蛋白质.氨基酸序列比较结果,RTV的ATPase基因与虹彩病毒科蛙病毒属的代表种FV3的一致性最高,为87.9%,与该科其它脊椎动物病毒的一致性在50%～52%之间.ATP酶蛋白质结构域分析可知该基因编码的ATP酶含有Walker型ATP酶AAA族蛋白质的全部结构域,其中既具有Walker型ATP酶所具有的Walker A和Walker B保守区,还含有AAA族蛋白质基因所具有的SRH高度保守区,因此,该基因是一完整的活性蛋白编码基因.