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甘氨酸构象异构化机理的密度泛函理论研究

         

摘要

采用B3I。YP/6—31++G**方法研究甘氨酸构象间转化机理,进而解释实验结果.优化得到了7个稳定极小,稳定次序为Ip〉Ⅱn〉1Vn〉Ⅲp〉Vn〉Ⅵp〉Wn;找到了9个过渡态.分子内C—N键、C—C键和c一0键的旋转导致构象转变,能垒分别处于0.25~9.43kJ/tool、10.53~15.79kJ/mol和23.96~61.43kl/mol范围内.为了理解实验结果,计算了445K(实验温度)各构象的热动力学性质,认识到:构象VIP和Ⅶn单向转化为低能构象,很快消失;构象ⅢP和Vn沿着Ⅲp→Vn→Ⅳn→IP方向快速转变为低能构象,数量迅速减少,导致谱图上难以分辨.构象IP是最稳构象,Ⅱn不能转化(能垒过高),Ⅳn可由IP直接转化,所以实验上只观测到3种构象.

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