新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析

摘要

通过数值分类和16S rDNA PCR-RFLP分析,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究,发现了一个新类群.在此基础上,进行了中心株AI-3的16S rDNA全序列分析,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较,得到系统发育树状图.在此树状图中,大多数参比菌株聚在一起,其16S rDNA全序列的同源性在96%以上,而AI-3与参比菌株的16S rDNA全序列相比,其相似性低于75%.但是,AI-3与Alcanivorax borkumensis[1]的16S rDNA全序列的相似性为96%,与Halobacilluslitoralis的16S rDNA全序列的相似性为99%,三者构成一个独立的发育分支.这说明在系统发育上,AI-3与参比菌株属于不同的分支,是一个新的类群.在新类群内,菌株之间的DNA同源性大于70%,而中心株AI-3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)的DNA同源性为44%,表明新分离的菌株可能构成一个新种群.