一株新的胡萝卜软腐欧文氏菌的分离和鉴定

摘要

从大白菜软腐组织中分离出一株软腐病细菌BC1,经过形态观察、生理生化特性分析、致病性检测和16S rDNA序列分析,该分离物被鉴定为胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜亚种(Erwinia carotovora subsp.carotovora, Ecc)的一个新菌株,编号为BC1.这是首次从16S rDNA序列水平上对在我国分布的软腐欧文氏菌进行鉴定.Ecc BC1的16S rDNA序列与其它软腐欧文氏菌株的16S rDNA序列之间同源性达98.7%～99.3%,而且在系统发育树中独立于Ecc其它菌株.序列分析结果表明,Ecc BC1具有至少2种不同的16S rDNA序列,它们都在第459位和473位(相对于大肠杆菌16S rDNA序列)发生碱基突变,同一基因中两个突变位点之间彼此互补,处于16S rRNA螺旋H17颈部,而且这两处碱基变异只存在于BC1菌株中.通过与其它软腐欧文氏菌亚种和菌株16S rDNA序列进行比对分析,还进一步鉴定出一些BC1菌株特异的16S rDNA碱基突变位点.本文报道的Ecc BC1两个16S rDNA序列在GenBank中的登录号分别为AY309068和AY309069.