影响胃癌总体生存率的免疫相关基因筛选

摘要

目的 探讨胃癌免疫相关基因与患者预后和临床指标的相关性.方法 通过癌症基因组图谱数据库(TC-GA)下载胃癌患者的临床信息和基因表达信息,通过免疫相关基因数据库(ImmPort)下载免疫相关基因列表,筛选出差异表达且影响胃癌术后总体生存率的免疫相关基因,然后与临床指标结合通过多因素COX回归分析筛选出独立影响预后的免疫相关基因.研究筛选出来的免疫相关基因与免疫细胞的相关性,以及与肿瘤微环境的相关性,并对筛选的基因进行通路富集分析.结果 NOX4基因(χ2=4.2,P=0.041)、SLC22A17基因(χ2=6.6,P=0.010)、DKK1基因(χ2=7.4,P=0.007)为影响胃癌预后的独立风险基因.在胃癌中NOX4基因、SLC22A17基因与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润量均有相关性(均P<0.05),DKK1基因与CD8+T细胞和巨噬细胞的浸润量具有相关性(均P<0.05).通过肿瘤微环境评分分析发现,在胃癌中NOX4基因、SLC22A17基因的表达与肿瘤基质细胞和免疫细胞量具有相关性,差异均具有统计学意义(均P<0.01).通过基因通路富集分析发现,影响预后的免疫相关基因可能与细胞因子生物合成过程的调控、细胞因子代谢过程和细胞因子受体间相互作用等基因通路具有一定相关性.结论 NOX4、SLC22A17、DKK1等免疫相关基因是影响胃癌预后的独立风险因素,与肿瘤微环境和免疫细胞浸润有明显的相关性.