栽培玉米亚种5 S rDNA NTS序列分析及FISH定位方法比较

摘要

选取我国7个栽培玉米亚种材料,进行5 S rDNA的非转录间隔区(nontranscribed intergenic spacer,NTS)的序列分析,比较7个亚种材料NTS序列差异并进行聚类分析,探讨其亲缘关系.研究结果表明:7个材料的NTS区GC平均含量为45.67%,核苷酸位点变异位点个数1～15,转换/颠换率为0.83～2.0,特用玉米材料均存在不同程度的缺失;7个材料主要聚为两大类,第一类群中包括甜质、马齿、硬粒、爆裂和蜡质5个亚种材料,第二类群中包括粉质和甜粉2个亚种材料.同时利用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)对5 S rDNA进行定位,探针标记分别采用荧光素标记和生物素标记.结果表明:生物素标记检测系统灵敏度高、杂交信号强,更适合于5 S rDNA重复序列的定位检测.