黄牛(Bos taurus)基因组P450基因家族的分析

摘要

利用黄牛基因组cDNA和氨基酸数据库对P450基因进行搜索和分析,结果显示:在黄牛基因组中发现64个P450基因,分别属于18个P450家族和38个亚家族.以氨基酸序列相似度大于60%为标准对黄牛P450基因进行分组,32个为孤儿基因,其余32个可归入9个组,其中7个组适合于正选择和基因转换分析.结果表明:有3个组显著受到正选择压力作用,其中的2个组有正选择概率大于95%的氨基酸位点,分别位于底物识别位点SRS1和SRS2;有5个组显示显著的基因转换事件;既显著受到正选择压力作用,又参与基因转换的基因共4个.可见,发生基因转换的基因与受到显著正选择的基因有一定的相关性.此外,鉴定出20个不同的基序,其中有6条基序在90%以上的基因中出现.