长江草鱼不同群体EST-SSR多态性标记的筛选及其遗传结构分析

摘要

为对我国不同地域草鱼群体进行鉴定和遗传多样性分析,在2400条草鱼EST序列中,对其二碱基至五碱基重复序列进行筛选,共筛选出微卫星位点181个,选取其中的46个进行引物的设计与合成,获得呈多态性的微卫星引物9对.利用这9对引物对8个长江水系草鱼群体和1个红色草鱼自然突变群体进行了遗传结构分析.结果显示,长沙草鱼、安庆草鱼、嘉兴草鱼、靖江草鱼、石首草鱼、松江草鱼、瑞昌草鱼、邗江草鱼和红色突变草鱼9个群体的平均等位基因数(Na)分别为4.67、5.22、5.33、5.00、4.89、4.78、4.89、4.67和2.56,平均期望杂合度(He)分别为0.6397、0.6543、0.6831、06356、0.6737、0.6483、0.6664、0.7129和0.4696,平均多态信息含量(PIC)分别为0.5787、0.6126、0.6283、0.5894、0.6217、0.5956、0.6136、0.6582和0.3949,表明邗江草鱼的遗传多样性最高,而红草鱼的遗传多样性最低.聚类分析表明,8个长江水系草鱼群体首先聚类,最后与红色草鱼聚类;其中,安庆草鱼与松江草鱼首先聚为一支,遗传距离较近,为0.0725;红色草鱼与长沙草鱼的遗传距离最远,为0.5217.研究结果对我国草鱼种质资源保存、种群鉴定和良种选育具有重要意义.