陆地棉EST-SSRs在向日葵中的通用性研究

摘要

利用陆地棉EST-SSRs(Expressed sequence tags-simple sequence repeats)在陆地棉和向日葵品种中进行了通用性分析.利用本实验室合成的1 500对陆地棉EST-SSRs在4个陆地棉品种中进行了扩增,有效扩增比率为95%,扩增产物符合预期大小(50～500 bp);每对引物可以检测到1～6个数目不等的片段(allele),平均约为2.7个;每2个陆地棉之间大约有7%～9%的多态性.从1 500对陆地棉EST SSRs引物中选取400对引物在向日葵中进行了扩增,有效扩增比率为63%,每对引物可以检测到1～6个数目不等的片段,平均为1.7个,片段大小介于50～500 bp之间.选取了200对在向日葵中得到有效扩增的引物对向日葵G101的父母本进行了多态性筛选,约25%引物具有多态性.结果表明,陆地棉EST-SSRs在向日葵中具有较高的通用性,可用于向日葵比较基因组研究和分子标记研究.