人肺腺癌细胞A-549和正常细胞HBE的蛋白质组差异分析

摘要

为了研究人肺腺癌细胞A-549和正常细胞HBE的蛋白质组差异, 用固相pH梯度双向凝胶电泳分离人肺腺癌细胞系A-549和正常细胞HBE的总蛋白质, 银染显色, PDQuest 2-DE软件分析, 对部分差异蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)测定其胶内酶解后的肽质指纹图谱, 用PeptIdent软件查询SWISS-PROT数据库. 结果获得了分辨率和重复性均较好的双向电泳银染图谱, 图象分析探测到A-549 2-DE图谱的平均蛋白质点数为 (890±38)个, HBE的平均蛋白质点数为(757±27)个, 不同胶间蛋白质点的位置偏差在IEF 方向为(2.85±0.48) mm, 在SDS-PAGE方向为(2.69±0.37) mm. 差异表达分析发现A-549 和HBE图谱有535个蛋白质点相互匹配, 其中A-549有355个未被匹配, HBE中有222个未被匹配; 对A- 549和HBE中的18个差异蛋白质点分别进行肽质指纹分析, 经数据库查询, 初步鉴定为一些与物质代谢、细胞因子、信号转导有关的蛋白质. 提示人肺腺癌细胞A-549和正常细胞H BE的蛋白质组具有差异, 这种蛋白质组的差异分析有助于进一步研究肺腺癌的相关蛋白质及分子标记物.