从核糖体DNA ITS区序列研究甘蔗属及其近缘属种的系统发育关系

摘要

测定了甘蔗属及其近缘属的13个种共43个个体和1个橡草(Pennisetum schumach)外群的核糖体DNA中的内转录间隔区(ITS)及5.8S rDNA 基因的序列.结果表明:甘蔗属及其近缘属种的ITS区(含ITS1,5.8S rDNA和ITS2)序列的长度范围为589～591bp,变异位点为140个,信息位点为60个;其中,ITS1和ITS2的长度范围分别为205～208bp和216～220bp,变异位点分别为64和68个,信息位点分别为33和24个;5 .8S rDNA长度范围为164bp,变异位点为8个,信息位点为3个.以狼尾草属的橡草(P.sch umach)作为外群,运用PAUP4.0b软件构建的系统发育NJ树表明:浙江果蔗(R45)应属于热带种(S. officinarum);河王八属与蔗茅属的亲缘关系较近,各自的金猫尾种与蔗茅种、河王八种与滇蔗茅种分别交叉聚在2个不同的小分支中;斑茅(S. arundinaceum或E. ar undinaceum)具有其他属不同的特异位点,是距甘蔗属较远的一个独立分支,从分子水平上提出了斑茅并不属于甘蔗属的观点,但其是否属于蔗茅属,还是应当立为单种属则需进一步的研究论证.