重组自交系群体的检测调整方法及其在大豆NJRIKY群体的应用

摘要

重组自交系(RIL)群体是遗传作图和QTL定位研究中常用的群体,构建过程中可能出现的异常偏分离会影响群体的使用.根据理论群体的分析,提出了用均等性、对称性和代表性3类χ2检验评价试验群体;利用代表性测验的家系最大χ2值和家系异常偏分离率调整异常偏分离的群体;并且应用计算机模拟方法编制了确定群体代表性测验参数临界值的有关程序(GenoSim);从而提出了重组自交系群体评价与调整的方法,称为模拟群体抽样标准法(SPSC).应用此方法,对大豆RIL群体NJRIKY进行了检测和调整.该群体由科丰1号×南农1138-2的201个F2∶7∶9家系组成,经SPSC 3个测验后淘汰了17个家系、5个标记,调整后的群体能通过3个测验,且在构建遗传图谱中,改变了19个标记及2个连锁群的组成.