家稗丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因的克隆及序列分析

摘要

为揭示C4植物家稗[Echinochloa crusgalli var. frumentacea(Roxb.)W.F.Wight] PPDK结构和功能特点,探索改善作物高光效途径,采用RT-PCR技术,克隆了家稗丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因的cDNA全长.核苷酸序列分析表明, 该片段全长3 085 bp, 包含一个2 844 bp的开放阅读框,编码948个氨基酸(GenBank登录号:AY 792619).编码区核苷酸序列与高粱(Sorghum bicolor)、甘蔗(Saccharum officinarum)、玉米(Zea mays)等C4型pdk基因同源率分别为85.1%、84.0%和82.0%;与水稻[Oryza sativa (japonica cultivar-group)] pdk基因同源性也高达82.6%.氨基酸序列进化树分析表明,其与玉米、水稻等禾本科植物最为接近.半定量RT-PCR研究表明,pdk基因仅在绿色叶片中表达.