栽培稻种内rDNA基因IGS序列分析及系统学意义

摘要

以普通野生稻为对照,将rDNA基因间区(IGS)序列用于栽培稻种内不同亚种以及亚种内不同品种的亲缘关系分析.结果表明,栽培稻种内IGS序列长度为2 130～2 145 bp,G+C含量为74.59%～75.29%.变异位点229个,占10.70%,信息位点76个,占3.51%.IGS序列中籼亚种和粳亚种之间有38个亚种标志性碱基差异,主要分布在IGS 5'端近400 bp的序列中.用IGS序列构建的系统树能将栽培稻的籼亚种和粳亚种分为两大类,亚种内不同亲缘关系的品种也能区分开.本研究结果支持爪哇稻为栽培稻中一个独立亚种的观点.