大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析

摘要

NIPs(nodulin 26-like intrinsic proteins)是类根瘤菌26膜内在蛋白,属于水孔蛋白的一个亚类,在植物逆境胁迫应答过程中发挥重要作用.利用大豆基因组数据库,在全基因组水平共鉴定得到13个GmNIPs.染色体定位分析显示,这些GmNIPs基因分布在大豆11条染色体上.理化性质分析显示,GmNIPs蛋白氨基酸数目为261～296,蛋白分子量为27～32 ku,蛋白等电点为6～10.蛋白多序列比对分析发现,所有GmNIPs均含有水通道蛋白的典型结构,6个保守的跨膜螺旋(TM1-TM6)和2个保守的氨基酸元件NPA盒(Asp-Pro-Ala box).进化树分析发现,大豆GmNIPs与拟南芥和水稻NIPs分类完全一致.基因结构分析显示,所有GmNIPs基因均由5个外显子和4个内含子组成.启动子分析表明,多数GmNIPs基因的上游启动子区含有逆境和激素应答元件.组织表达分析发现,5个GmNIPs的基因表达量相对较高.进一步,利用荧光定量PCR对GmNIP1;5的干旱胁迫表达特性进行了分析.