粘质沙雷氏菌几丁质酶(ChiC)基因克隆及其生物信息学分析

摘要

从粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens ATCC14041)中克隆出几丁质酶基因(ChiC),将回收纯化的PCR产物与载体pMD18-T连接,构建成的重组质粒命名为pMD-ChiC,将重组质粒转化到受体E.coli DH5α中进行克隆,经BamHⅠ和Nhe Ⅰ双酶切验证、核酸序列测定证实,重组质粒pMD-ChiC含有几丁质酶C基因(ChiC).利用生物信息学的方法,推测该粘质沙雷氏菌ChiC基因编码的蛋白质由480个氨基酸组成.预测该蛋白的等电点为5.63,分子量约为52kD.针对粘质沙雷氏菌中的几个几丁质酶基因做了进化树,进而验证了粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)几丁质酶(ChiC)在沙雷氏菌几丁质酶中的分类;同时对粘质沙雷氏菌几丁质酶C(ChiC)蛋白的高级结构作出了预测,得到其编码的属于18家族的蛋白质高级结构图谱.