新发猪流行性腹泻病毒分子变异分析

摘要

采用RT-PCR方法对5份疑似流行性腹泻病毒感染猪场采集的腹泻粪便样品和小肠组织样品进行扩增、克隆和测序,并利用DNAStar进行序列对比及进化分析.结果表明:5个PEDV S及ORF3基因核苷酸序列同源性为96.2％～99.6％,氨基酸同源性为86.3％～99.3％.与经典病毒株CV777相比,CH-GZH毒株在PEDV S基因3 581～3 583 bp处存在3个核苷酸缺失;CH-ZJ毒株在ORF3基因245～293 bp处缺失49个核苷酸.S及ORF3基因进化树分析结果表明,4株PEDV与中国毒株BJ-2011～1亲缘关系较近;CH-ZJ独立于其他中国病毒株独自构成一个群体,与其他病毒株有较大差异.