番茄SlWRKY6基因克隆及其在重金属胁迫下的表达分析

摘要

为了揭示SlWRKY6基因与植物重金属胁迫的相关性,通过RT-PCR的方法从番茄中克隆得到SlWRKY6基因,该基因序列号为:NM_001365762.1.生物信息学分析结果表明,该基因含有一个长度为1342 bp的完整开放阅读框,编码447个氨基酸残基.该基因编码的蛋白含有一个WRKY结构域,属于典型的GroupⅡ亚家族成员.系统进化分析表明,与番茄SpWRKY31氨基酸序列之间的亲缘关系最近.组织特异性分析表明,SlWRKY6基因在番茄的不同组织中均有表达,在老叶中表达量最高.实时荧光定量PCR分析结果表明,SlWRKY6基因在3种重金属(CdCl2、CuCl2、HgSO4)胁迫下均上调表达,且在Cd和Cu胁迫下番茄根部的表达量较高.CdCl2胁迫下,SlWRKY6基因在番茄根中受胁迫诱导显著高于叶中;CuCl2胁迫下,番茄叶中SlWRKY6基因表达量在3 h时达到最大值后降低,而根中的SlWRKY6基因水平随着浓度增加而下降;HgSO4胁迫下,根部和叶片该基因的表达量显著高于对照(0 h),并随着HgSO4胁迫时间延长,SlWRKY6基因相对表达量在番茄根和叶中呈现相反的趋势.综上,本研究获得了SlWRKY6基因的编码区序列,并初步阐述了番茄SlWRKY6基因在3种重金属胁迫下的表达情况,为筛选番茄中响应重金属胁迫功能基因的研究提供了研究基础.