马铃薯StNF-Y核转录因子基因的克隆和生物信息学分析

摘要

为了研究马铃薯StNF-Y基因在非生物逆境中的作用与功能,在马铃薯抗青枯病基因型ED13中克隆了1个新的NF-YC转录因子(StNF-Y),并对其进行生物信息学分析,预测其生物学功能.结果表明,StNF-Y基因的全长cDNA为1132 bp,其开放阅读框为693 bp,编码230个氨基酸,氨基酸分子式为C1112 H1735 N317 O339 S10,等电点为5.37,含有13个磷酸化位点;StNF-Y蛋白分布在胞质中,无信号肽,属于亲水性蛋白,含有高度保守的结构域,属于BUR6 superfamily家族;二级结构显示,StNF-Y蛋白主要由45.65％的α-螺旋、5.65％的延伸链、45.22％的无规则卷曲和3.48％的β-转角组成.系统进化分析结果显示,马铃薯StNF-Y序列与番茄、辣椒和烟草NF-YC序列亲缘关系较近.此外,StNF-Y在多种植物胁迫中起作用.因此,推测StNF-Y可能参与马铃薯相关胁迫抗性的调节.研究结果可为以后进一步深入研究马铃薯StNF-Y的功能以及对逆境胁迫的抵抗机制提供理论依据.