马铃薯ERF4转录因子基因的克隆和生物信息学分析

摘要

AP2/EREBP家族是植物所特有的一类转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导,分为DREB,ERF,AP2,RAV和其他5个大的分支.ERF4是一个具有潜在核定位能力的乙烯反应元件结合蛋白,属于ERF类,在马铃薯(Solanum tuberosum)防御反应中发挥作用。本文通过接种青枯菌(Ralstonia solanacearum),在马铃薯栽培品种"MS 42.3"和"中薯3号"中获得ERF4的cDNA克隆,并利用生物信息学方法对该基因核苷酸组成及编码产物氨基酸的组成、理化性质、结构和功能等方面进行预测。序列分析结果表明:该基因包括672 bp核苷酸;编码223个氨基酸;氨基酸分子式为C1067H1668N3240330S9;等电点为8.78;包含三个二硫键和二十个磷酸化位点;该蛋白分布在细胞核中;无信号肽存在;属于亲水性的非球状蛋白，此外,ERF4与多种植物中与乙烯响应有关的转录因子具有高度的同源性,因此推测ERF4可能与马铃薯相关抗逆基因的调控表达有关。