电子克隆

摘要： 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UDP glucose dehydrogenase,UDP-GlcDH)可将UDP葡萄糖催化生成多糖形成必需的前体物质UDP葡萄糖醛酸。以黄曲霉的UDP-GlcDH基因序列为模板,采用电子克隆的方法,搜索灵芝EST文库,拼接获得灵芝UDP-GlcDH基因的cDNA序列,并通过RT-PCR试验进行验证。采用生物信息学方法对UDP-GlcDH基因进行分析,表明该cDNA序列长度为1 591bp,其中包含能编码471个氨基酸的序列,分子量为51.8kD,PI为6.29,存在于内质网膜中,与污叉丝孔菌和云芝等真菌中的UDP-GlcDH基因编码的氨基酸序列高度同源。

摘要： 多种薯蓣属植物全基因组测序工作的完成,为利用生物信息学手段对薯蓣属植物的基因进行电子克隆、结构与功能分析以及分子进化分析提供了便利。淀粉是薯蓣属植物地下块茎的重要组成成分,颗粒结合淀粉合成酶(GBSS)是淀粉合成过程中控制直链淀粉合成的关键酶。本研究以文成糯米山药GBSS基因序列为探针,电子克隆方法获得参薯、几内亚白山药、灌丛薯蓣和盾叶薯蓣4种薯蓣属植物的GBSS基因序列。通过生物信息学分析方法,比较分析4种薯蓣属植物GBSS基因结构、蛋白质结构及系统发育特点。结果可为进一步研究薯蓣属植物GBSS基因及其编码蛋白调控淀粉合成的分子机制提供科学依据。

摘要： ODB基因在植物同源重组依赖性的DNA双键断裂修复过程中起重要作用,对植物诱变育种具有潜在的应用价值.克隆烟草NtODB基因并分析其表达特征为丰富ODB基因在同源重组DNA修复过程中的作用提供证据.为得到烟草NtODB基因序列,采用电子克隆技术获得该基因cDNA序列并克隆验证.进一步使用生物信息学方法分析该基因表达特征,对预测蛋白的理化性质、信号肽、高级结构等进行预测.生物信息学分析结果表明,NtODB基因开放阅读框包含579个碱基,蛋白含192个氨基酸残基,NtODB蛋白具有碱性和亲水性,主要定位于细胞质内;实时荧光定量PCR检测结果显示NtODB基因在不同组织中呈现组成型表达特征;亚细胞定位检测提示NtODB主要表达于细胞膜和叶绿体.NtODB基因的克隆与表达分析及其蛋白高级结构和理化性质的预测,可为进一步丰富ODB基因在同源重组依赖的DNA修复系统中的作用机制提供证据.

摘要： Δ9-硬脂酰-ACP脱氢酶(stearoyl-acyl carrier protein delta 9-desaturase,SAD)是植物响应逆境胁迫的关键酶,在响应低温胁迫中发挥着重要的作用,克隆木薯(Manihot esculenta)SAD基因对抗寒机理及品种改良研究具有很大的理论意义和现实意义.本文以拟南芥(Arabidopsis thaliana)的S A D同源蛋白为探针,利用电子克隆技术,得到木薯SAD的cDNA,并对表达蛋白的一级至高级结构、结构域、基本理化性质及系统发育等进行生物信息学分析.结果表明,木薯SAD基因cDNA长度为1685 bp,开放阅读框(ORF)为176～1366 bp,编码396个氨基酸,主要包含α螺旋以及无规则卷曲序列.该蛋白主要定位在叶绿体基质内,包含酰基-ACP脱氢酶结构域,具有酸性和亲水性.系统进化分析显示,木薯与蓖麻(Ricinus communis)、巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)和麻疯树(J atropha curcas)等植物亲缘进化关系非常相近.本研究结果可为MeSAD基因功能解析、木薯抗寒机理及耐低温品种改良等奠定基础.

摘要： HSP21是植物响应高温胁迫的关键基因,在防止蛋白变性、保护细胞结构和维持植物正常生长发育等方面发挥重要作用,克隆HSP21基因是揭示木薯抵抗高温胁迫分子机制的基础.为得到木薯HSP21同源基因及分析其表达蛋白的性质,文中采用电子克隆技术对新基因进行组装和衍生,并使用生物信息学分析方法,对预测蛋白的一级至高级结构、亲水性/疏水性、信号肽、蛋白同源性和系统进化等进行全面解析.结果 表明,HSP21基因含有969个碱基对,其开放阅读框有705个碱基,预测蛋白含234个氨基酸.预测蛋白是非跨膜蛋白,具有碱性和亲水性,主要定位于叶绿体内.通过多重序列比对和系统进化分析发现,木薯与巴西橡胶树、蓖麻和麻疯树等植物的HSP21蛋白同源性较高.结果 可为该基因的克隆和转化提供参考依据.

摘要： 目的:果糖激酶是促进果糖磷酸化关键代谢步骤重要的酶.通过电子克隆技术对葛枣猕猴桃果糖激酶基因进行预测.方法:以毛花猕猴桃果糖激酶序列为探针,基于美国国立生物技术信息中心(NCBI)中葛枣猕猴桃的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析.结果:葛枣猕猴桃果糖激酶基因全长1015 bp,包含957 bp的开放阅读框,编码318个氨基酸,该蛋白为疏水性蛋白.结论:本研究为进一步解释葛枣猕猴桃果糖激酶基因的分子功能奠定理论及实验基础.

摘要： 为了研究马铃薯StNF-Y基因在非生物逆境中的作用与功能,在马铃薯抗青枯病基因型ED13中克隆了1个新的NF-YC转录因子(StNF-Y),并对其进行生物信息学分析,预测其生物学功能.结果表明,StNF-Y基因的全长cDNA为1132 bp,其开放阅读框为693 bp,编码230个氨基酸,氨基酸分子式为C1112 H1735 N317 O339 S10,等电点为5.37,含有13个磷酸化位点;StNF-Y蛋白分布在胞质中,无信号肽,属于亲水性蛋白,含有高度保守的结构域,属于BUR6 superfamily家族;二级结构显示,StNF-Y蛋白主要由45.65％的α-螺旋、5.65％的延伸链、45.22％的无规则卷曲和3.48％的β-转角组成.系统进化分析结果显示,马铃薯StNF-Y序列与番茄、辣椒和烟草NF-YC序列亲缘关系较近.此外,StNF-Y在多种植物胁迫中起作用.因此,推测StNF-Y可能参与马铃薯相关胁迫抗性的调节.研究结果可为以后进一步深入研究马铃薯StNF-Y的功能以及对逆境胁迫的抵抗机制提供理论依据.

摘要： 目的：本研究旨在电子克隆绵羊MRF4基因cDNA序列,对基因及其编码蛋白的结构进行预测和分析. 方法：利用GenBank数据库中牛MRF4基因的cDNA序列,作为探针序列电子克隆出绵羊的MRF4基因.对绵羊MRF4基因进行开放阅读框和结构分析,与山羊、牛、猪、人、小鼠和鸡等物种进行相似性比对,并构建MRF4基因和MRF4蛋白的系统进化树;并使用相关在线工具及软件对绵羊MRF4蛋白的蛋白质二级结构、跨膜区、磷酸化位点、糖基化位点和三级结构、理化特性和功能进行预测和分析. 结果：结果表明,绵羊MRF4基因位于3号染色体上,有3个外显子,cDNA长为858bp,包含729bp的开放阅读框,可编码242个氨基酸;绵羊MRF4蛋白的谷氨酸含量最多,该蛋白质呈酸性;与绵羊MRF4基因编码区相似性由远及近依次是与山羊(99％)、牛(99％)、猪(95％)、人(94％)和小鼠(90％),说明MRF4极其保守;绵羊、山羊和牛在MRF4基因进化树和MRF4蛋白进化树中进化关系最为接近;绵羊MRF4蛋白没有跨膜结构;绵羊MRF4蛋白有29个磷酸化位点;有5个氧的糖基化位点,1个氮的糖基化位点:蛋白质的二级结构预测表明绵羊MRF4蛋白二级结构仅有α-螺旋;蛋白质的三级结构预测结果显示绵羊MRF4蛋白具有螺旋-环-螺旋结构;对于绵羊MRF4蛋白功能的预测结果表示蛋白质出现复制和转录功能、调控功能和翻译功能的概率最大. 结论：预测分析结果为绵羊MRF4基因的实验克隆和进一步功能研究奠定基础.

摘要： 超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)与小麦的多种逆境抗性密切相关.本研究以NCBI中的EST数据库为主要数据来源以一系列生物信息学软件为工具进行了SOD基因的电子克隆及生物信息学分析.结果表明:通过电子克隆方法获得了SOD基因的编码区全长序列,该预测的SOD蛋白质氨基酸序列与数据库中同类基因的蛋白质氨基酸序列具有极高的相似性,并且含有完整的保守结构域;本研究电子克隆到的SOD基因编码的不是分泌蛋白,也不是膜蛋白,而是胞质蛋白.结论:通过某个基因的一个EST序列采用电子克隆的手段进行基因全长的电子拼接是可行的.

摘要： 本实验室前期以太空诱变后生物学性状发生了改变的宫颈癌Caski细胞株48A9作为Tester,地面常规对照组宫颈癌Caski细胞株作为Driver构建消减杂交文库,通过反向Northern杂交成功筛选得到多个差异表达基因.经后期分析发现一条长为754bp的片段,存在于2号染色体2q37.1位置,无已知基因与其同源,3'端存在加尾信号AATAA及polyA尾,暂时命名为C4,值得进一步研究。rn 目的:通过电子克隆尝试将该片段进行延长,以期获得较长的3'端片段,为5'RACE扩增基因全长降低难度;验证该片段是否切实存在及在不同细胞系中的表达情况。rn 方法:在NCBI中的EST数据库中进行Blast比对,使用与C4片段同源性大于95％且同源长度在100bp以上的EST片段进行拼接延伸;TRIzol法抽提Huvec、H8、Hacat、Caski、SiHa、Hela细胞的总RNA,DNase I消化后等量逆转录成cDNA,验证C4在不同细胞中的表达及电子克隆所得片段的可靠性,并进行3'RACE扩增电子克隆所得序列。rn 结果:C4片段经EST数据库比对拼接后被延长至1605bp,通过PCR验证及3'RACE扩增确认拼接延长所得的1605bp序列结果正确;C4片段在宫颈癌细胞系Caski、SiHa、Hela中的表达均明显高于正常细胞系Huvec、H8、Hacat。rn 结论:C4片段3'端已确定且为与肿瘤相关的新基因。

摘要： 使用电子克隆技术获得Ipomoea trifida中的ANS基因cDNA序列,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析和预测,为进一步克隆该基因、研究番薯属花青素合成等问题提供依据.结果表明,Ipomoea trifida中ANS基因cDNA序列长度为1268bp,开放阅读框1095 bp,编码364个氨基酸残基;编码蛋白含有DIOX_N和20G-FeⅡ_Oxy结构域,属于Leuco-anthocyanidin Dioxygenase类;亚细胞定位分析显示,编码蛋白位于细胞质中;进化树中与番薯属ANSs序列位置最为接近.

摘要： GH425基因(genebank EST#：GPE204)来自毛尖紫萼藓干旱胁迫cDNA文库。本实验在小立碗藓核酸数 据库中，以CH425基因为基因探针进行电子克隆，最终得到全长序列GH425N0.1。经ORFfinder分析，以最长0RF设计引物，对毛尖紫萼藓进行RT-PcR验证，得到了与之对应的条带，证明了毛尖紫萼藓中含有电子克隆的片段，即电子克隆结果正确。经Blastx分析，确定该序列编码真核启动因子4E。

摘要： 由旋毛虫感染引起的旋毛虫病是一种危害严重的食源性人兽共患寄生虫病,入主要因为生食或半生食含有旋毛虫肌幼虫包囊的猪肉或其它动物肉类而感染,严重时可以致人死亡.本研究通过电子克隆的方法从GenBank数据库获得旋毛虫新生幼虫期半肤氨酸蛋白酶抑制剂基因的8条EST序列，序列分析表明这些EST来自来自同一基因，具有由666个核昔酸组成的开放阅读框架。推测其编码蛋白TsCystatin由221个氨基酸残基组成，蛋白分子量是24.3ku，理论等电点4.44，其第1位到第25位氨基酸残基为信号肤序列，具有3处N糖基化位点。该蛋白的二级结构中a螺旋占21.27%.p折叠占21.27%，转角占57.47%。结构域分析表明该蛋白具有一个cystatin样结构域，可能属于cystatin家族2，同源性分析表明与其它线虫cystatin具有很高的相似性。

摘要： SOCS基因是JAK/STAT信号通路的负调节基因。为了分析了解家蚕SOCS基因（BmSOCS）的遗传变异与进化，通过电子克隆获得SOCS cDNA基因序列，结果显示家蚕基因组中至少存在4种BmSOCS基因，BmSOCS-2基因存在可变剪接。通过RT-PCR从家蚕中扩增得到1个BmSOCS-2基因（BmSOCS-2A），测序结果表明，该792bp片段含有完整的ORF，由4个外显子组成，编码263个氨基酸残基，分子量为28.8kD。结构分析显示BmSOCS-2A有5个α螺旋结构，存在典型的SH2结构域和SOCS结构域。基因芯片数据分析结果显示，BmSOCS-2在家蚕雌雄性腺组织中表达量最高。进化分析表明，SOCS以不同种类聚类在一起，表明各种SOCS基因在各昆虫物种形成前就已产生SOCS基因家族。研究结果为深入了解BmSOCS-2的功能奠定了基础。

摘要： 本实验拟通过生物信息学分析和RT-PCR产物直接测序等方法获得并验证猪Xist基因及其外显子序列，并希望通过敲除供体细胞Xist基因来提高猪的克隆效率。

摘要： 为了验证家蚕STAT基因在性细胞决定中的作用，了解STAT基因在家蚕雌雄性腺中的表达差异，通过电子克隆的方法克隆了家蚕STAT基因，并进一步通过RT-PCR获得了家蚕STAT的cDNA基因。通过构建的pET28a-STAT原核表达载体进行了诱导表达，SDS-PAGE检测表明82kD的融合重组蛋白被高效表达。重组蛋白经His柱纯化后，再经SDS-PAGE染色切胶收集作为抗原，免疫小鼠获得了多克隆抗血清，对来自家蚕雌雄性腺蛋白的western blotting检测表明，在家蚕的雄蚕性腺中，可检测到2条特异约82kD的蛋白质条带，推测STAT基因存在可变剪接。

摘要： 基于电子延伸序列,本试验克隆并分析了猪FIT2基因;各种组织提取总RNA,利用设计的引物进行RT-PCR,PCR产物与pMD 19-T载体连接后转化Ecol.JMl09,检测阳性克隆并测序.猪FIT2基因长为1776bp,ORF为82-870bp,编码262个氨基酸.同源分析结果表明,FIT2的核酸序列与小鼠、大鼠和人的同源性分别为85,0％、85.7％和88.1％,氨基酸序列的同源性分别为87.4％、87.4％和92.0％.组织分布结果显示:FIT2在心、肝、脾、肾、大脑、小脑、空肠、回肠、甲状腺、肌肉和脂肪等组织都有分布.

摘要： 本申请公开了一种代码克隆检测方法，包括：获取至少两个版本的源代码组成的源代码集；将所述至少两个版本的源代码分别转换为对应的代码特征向量；将所述至少两个版本的源代码对应的代码特征向量输入集成分类模型进行克隆检测，获得克隆检测结果。所述代码克隆检测方法，通过提取源代码各自的特征信息将其转换为代码特征向量，在代码特征向量的基础上利用集成分类模型实现克隆检测，从而降低了源代码的特征损失，在此基础上实现的代码克隆检测更加精准，同时也更具有效性。

摘要： 本发明提供一种漏洞代码克隆检测方法、装置、电子设备和存储介质，其中方法包括：对待检测函数的代码进行切片，得到多个待检测切片；将所述多个待检测切片与预设漏洞库中存储的漏洞函数对应的所有漏洞切片进行切片匹配，得到所述待检测函数的漏洞代码克隆检测结果；其中，所述漏洞函数对应的漏洞切片中包含所述漏洞函数中需要删除的语句以及与所述需要删除的语句存在依赖关系的其他语句。本发明提供的漏洞代码克隆检测方法、装置、电子设备和存储介质，实现了Type‑3类型的代码克隆检测，提高了漏洞代码克隆检测的全面性和准确性，减少了漏洞的漏检率，且可以准确定位待检测函数中漏洞信息所在的位置。

摘要： 本发明公开了一种基于打印电子技术的环形振荡器物理不可克隆函数电路，其特征在于，包括PET基板、两组导电圆点单元、第一环形振荡器电路、第二环形振荡器电路、输入选择器和第一逻辑控制单元，两组所述导电圆点单元采用纳米铜粒子打印在PET基板上呈点阵排列，第一环形振荡器电路和第二环形振荡器电路中的计数器输出端分别与所述第一逻辑控制单元的输入端连接。本发明利用打印电子点阵导电的不确定输出来为环形振荡器选择接入电路的反相器，整个PUF电路的随机性就包含打印电子点阵导电的随机性和反相器延时的差异，相比较于传统RO PUF提高了电路的安全性和鲁棒性。

摘要： 本申请提供一种卷克隆方法、装置、电子设备及机器可读存储介质。在本申请中，响应于针对所述源卷的卷克隆指令，创建与所述源卷对应的若干目标卷；基于与所述若干目标卷对应的共享缓冲区，将所述源卷的数据拷贝至所述若干目标卷；仅基于一个共享缓冲区而不是多个共享缓冲区，将源卷的数据拷贝到若干目标卷，从而实现在卷克隆时，减少了对源卷的读IO，提高了卷克隆效率。

摘要： 本发明提供一种面向电子表格的表克隆自动化检测方法及电子装置，包括：根据电子表格中的空白行与空白列，将电子表格划分成若干物理块；通过查找每一物理块的行表头与列表头及合并相应的物理块，得到若干子表格；依据子表格中每一单元格的特征，计算各子表格之间的相似性，判断子表格之间是否存在表克隆。本发明可以自动化检测出电子表格中的表，建模并抽取表的结构与格式特征，并基于这些特征的相似度，准确识别表之间的克隆关系，能够更全面、准确的识别电子表格中各种表克隆情况。

摘要： 使用半导体制造工艺制造集成电路。半导体制造工艺中的一个或多个不可控制的随机物理过程可以导致集成电路与其他类似设计的集成电路之间的小差异。这些小差异可能导致集成电路的晶体管具有不同的阈值电压。集成电路可以使用这些不同的阈值电压来量化其物理唯一性，以将其自身与由半导体制造工艺类似地设计和制造的其他集成电路区分开。本发明的实施例还涉及物理不可克隆功能电路和确定电子器件的电子签名的方法。

摘要： 本发明涉及语音克隆领域，公开了一种语音克隆方法、装置、训练方法、电子设备及存储介质。本发明中，语音克隆方法，包括：使用第一神经网络模型对待克隆语音的特征进行解耦合、得到所述待克隆语音的说话人特征，所述说话人特征为所述待克隆语音中与文本内容无关的特征，所述第一神经网络模型为多层神经网络模型；对待合成文本进行编码、得到所述待合成文本的文本内容特征；使用第二神经网络模型对所述待克隆语音的说话人特征和所述待合成文本的文本内容特征进行耦合，生成克隆语音。与现有技术相比，本发明实施方式所提供的语音克隆方法、装置及语音克隆装置的模型训练方法具有语音克隆模仿能力较强、训练数据量依赖性更低的优点。

摘要： 本发明提供一种行为克隆方法、电子设备、存储介质和程序产品，行为克隆方法，包括：确定当前状态向量序列和上一时刻决策序列，上一时刻决策序列包括上一时刻状态向量序列和上一时刻状态向量序列对应的动作向量；将当前状态向量序列和上一时刻决策序列输入行为克隆模型中，得到行为克隆模型输出的当前状态向量序列对应的预测动作向量；行为克隆模型基于当前状态向量序列与上一时刻状态向量序列的关联性，对当前状态向量序列进行预测动作向量的预测；行为克隆模型是基于相邻时刻的样本决策序列训练得到的。本申请旨在解决现有技术中行为克隆方法只能建立单个状态到动作的映射的关系，导致传统的行为克隆方法的学习性能较低的缺陷。

摘要： 本申请涉及一种基于知识图谱的代码克隆检测优化方法、装置和电子设备。该方法通过获取多个待检测代码片段，并采用预定筛选策略对其对应的候选代码片段集合进行筛选得到对应初始候选代码片段集合；利用知识图谱的知识对初始获选代码片段进行筛选，得到优化后的候选代码片段集合；采用预设克隆检测方法检测每个待检测代码片段与对应的优化后的候选代码片段集合中的每个候选代码片段之间的克隆关系，并根据得到的克隆检测结果构建优化后的克隆知识图谱；根据克隆知识图谱，得到优化后的所有克隆对集合。本方法未对现有克隆检测方法进行修改，不会改变原有克隆检测方法准确度，同时本方法对开发语言没有依赖性，可以适用于现有所有克隆检测方法。

摘要： 本发明公开了一种克隆虚拟模型的方法、装置、存储介质及电子装置。该方法包括：获取第一虚拟模型和第二虚拟模型，其中，第一虚拟模型为游戏场景中待使用的虚拟主体模型，第二虚拟模型为虚拟主体模型的表面上待摆放的虚拟细节模型；在第一虚拟模型上选取克隆范围，其中，克隆范围用于确定第二虚拟模型在第一虚拟模型的表面上的摆放区域；基于克隆范围将第二虚拟模型克隆至第一虚拟模型，得到第三虚拟模型，其中，第三虚拟模型为第二虚拟模型与第一虚拟模型的虚拟组合模型。本发明解决了相关技术中通过人工对虚拟细节模型进行手动设计和随机摆放的方法其操作成本高、设计效果差、迭代修改难度大的技术问题。