陕北黄芥黄籽基因IP标记的开发

摘要

以(吴旗黄芥×武功芥菜)F2代群体为材料,在前期研究基础上利用拟南芥、芸薹属基因组上已知的序列信息,发展与陕北黄芥粒色基因紧密连锁更近的内含子多态性(Intron Polymorphism,IP)标记.研究表明,在陕北黄芥黄籽基因与拟南芥基因组3号染色体的同源区域At3g14120～At3g29615内设计4对引物,发现At3g23030处的IP标记与黄籽基因连锁.将前期黄籽基因遗传连锁图谱上一个最近的AFLP标记EA02MC08侧翼序列利用PCR-walking技术延长,经BLAST分析将该标记成功定位到白菜A基因组A1染色体的BAC克隆(KBrH105I15)上,并根据此克隆序列设计10对引物进行IP标记开发,找到2对(Y3、Y7)IP标记与黄籽基因连锁.