青海沙地白刺根际解淀粉芽孢杆菌DGL1的牧草促生活性及其基因组分析

摘要

本研究测定了分离自青海大格勒干旱沙地白刺(Nitraria tangutorum)根围的解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)DGL1的生物学活性,并对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析.结果表明:通过平板对峙法测定菌株拮抗瓜类枯萎病菌(Fusarium oxysporum)、锐顶镰孢病菌(Fusarium acuminatum)、小麦赤霉病菌(Fu-sarium graminearum)活性,发现DGL1对3种病原真菌均具拮抗活性(抑菌圈平均直径均＞26 mm);采用羧甲基纤维素钠培养基测定菌株降解纤维素活性,发现菌株具有一定的降解纤维素活性;改良阿须贝(Ashby)无氮培养基检测证明菌株有固氮活性.对菌株促高原牧草燕麦(Avena sativa)、冷地早熟禾(Poa crymophila)、紫羊茅(Festu-ca rubra)、中华羊茅(Festuca sinensis)生长活性进行分析,发现DGL1具有促进4种牧草种子萌发和幼苗生长的能力;采用二代测序平台Illumina Hiseq×10对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析,表明菌株DGL1基因组DNA 全长3 915 550 bp,GC 含量为46.47％,CDS 数量为3 972,有86个 tRNA,27个 rRNA,与 COG,GO,KEGG数据库比对分别注释到2 970,2 926,2 160个功能基因.本研究结合生物特性与基因组分析对菌株DGL1进行了促生和抑菌相关功能基因预测,为其促牧草生长提供了理论依据.