Concordia University (Canada).;
机译:使用查询DNA序列的3D随机图对整个基因组进行无比对序列搜索
机译:CrisPasdB A的CrisPRDB继任者含有Crispr阵列和来自完整基因组序列的CAS基因,以及下载和查询重复和垫片列表的工具
机译:Genbit压缩工具(GBC):一种基于Java的工具,用于压缩DNA序列并计算基因组的压缩率(BITS / BASE)
机译:satDNA分析仪1.2作为对卫星DNA家族进行进化分析的重要计算工具:重新审视Rumex(ly科)的Y连锁卫星DNA序列。
机译:开发用于结构DNA纳米技术的工具和技术,并通过信使RNA展示鉴定翻译增强子序列
机译:CRISPRCasdb是CRISPRdb的后继产品其中包含来自完整基因组序列的CRISPR阵列和cas基因以及下载和查询重复序列和间隔区列表的工具
机译:图4:(a)一种保守序列,其发生在芯片-SEQ数据集中的46,264个结合位点峰值中的79倍。说明了这种保守序列的突变分布,其中'_'表示该碱度不变; del表示此基础丢失; INS X表示新的基础X插入此基础前面。 (b)列出了几种重复的元素模式。 (c)在第一栏中,示出了由MEME芯片工具(Machanick&Bailey,2011)开采的前五个DNA主题。由CFSP算法发现的相应保守序列列于第二列中。在第三列中,列出了从突变信息转换的特定位置的评分矩阵。 MEME主题与PSSM格式的相似性与PSSM格式之间的相似性通过邮票图章比较工具(Mahony&Benos,2007)计算。这些对相似性的电子值显示在第四列中。 (d)在由GKMSVM描述符聚集的每个组中选择了一个图案,下面列出了CFSP算法的相应主题。 (e)从https://www.encodeproject.org收集的,有附加数据集(文件no:cernff100grl,cenf616irl,conf8.20cer,target:srebf1)。使用MEME工具在每个文件中选择前两个图案,并且我们的算法发现的相应主题如下所示。