陆地棉遗传连锁图谱的构建与纤维相关性状的QTL分析

摘要

棉花是世界上最重要的天然纤维作物。随着纺织技术的不断改进以及人民生活水平的提高，对棉花纤维品质的要求也越来越高。如何在改良陆地棉产量的同时，尽快提高纤维品质成了产棉国政府和棉花育种者集中关注的问题。虽然传统的遗传改良方法在棉花品种改良中起来重要作用，但育种效率低，周期长。现代DNA标记技术的发展，为育种者提供了一种快速、准确的选择方法。 本文对陆地棉遗传连锁图谱的构建与纤维相关性状的QTL进行了分析研究。文章通过对不同遗传背景的陆地棉品种进行AFLP标记多态性筛选，发现陆地棉高品质品种渝棉1号与多显性基因标记系T586之间的DNA标记多态性高于其它陆地棉品种。本文利用SSR、AFLP和形态标记对(渝棉1号×T586)F2群体进行了遗传连锁图谱的构建，并利用(渝棉1号×T586)F2：3家系进行了纤维相关性状QTL的定位。

目录

文摘

英文文摘

资助

第1章文献综述

1.1 棉属的分类、起源与进化

1.1.1棉属的分类

1.1.2棉属的起源

1.1.3棉属染色体基数的来源

1.1.4棉属的进化

1.1.5棉属的染色体组与异源四倍体棉种的起源与进化

1.2棉花纤维品质遗传改良

1.2.1棉花遗传改良的简史

1.2.2棉花优异纤维品质基因的来源

1.4.3棉花纤维品质遗传改良的难点

1.2.4棉花纤维品质遗传改良的方法

1.2.5棉花纤维品质现状

1.2.6我国棉花纤维品质存在的主要问题

1.3棉花质量性状遗传与经典遗传图谱

1.3.1异源四倍体棉种的质量性状遗传

1.3.2异源四倍体棉种的经典遗传图谱

1.4棉花性状遗传的分子标记研究进展

1.4.1分子标记的类型与特点

1.4.2棉花分子遗传图谱的构建

1.4.3棉花数量性状基因/QTL定位

第2章引言

2.1研究的背景和意义

2.2研究内容

2.3技术路线

第3章材料与方法

3.1植物材料

3.2主要设备

3.3棉花基因组DNA提取

3.3.1提取试剂

3.3.2棉花基因组DNA提取方法

3.4 AFLP标记分析

3.4.1主要试剂及溶液配制

3.4.2 AFLP标记的PCR扩增

3.4.3 AFLP标记扩增片段的银染检测

3.5 SSR标记分析

3.5.1 SSR标记的PCR扩增

3.5.2 SSR标记扩增产物的银染检测

3.6作图群体的建立与性状统计分析

3.6.1亲本选择与群体建立

3.6.2纤维品质相关性状的考查与统计分析

3.7陆地棉遗传连锁图谱的构建

3.7.1亲本间标记多态性与F2群体单株标记基因型检测

3.7.2标记位点命名

3.7.3遗传连锁图谱的构建

3.8陆地棉纤维相关性状的QTL分析

3.8.1区间作图QTL分析

3.8.2复合区间作图QTL分析

3.8.3多区间作图QTL分析

3.8.4选择性基因型群体QTL分析

3.8.5 QTL效应的确定与命名

第4章结果与分析

4.1陆地棉作图亲本的筛选

4.2纤维相关性状的统计分析

4.2.1亲本和F2：3家系纤维相关性状的表型分析

4.2.2 F2：3家系纤维相关性状的相关分析

4.2.3小结

4.3陆地棉遗传连锁图谱的构建

4.3.1作图群体形态标记的基因型检测

4.3.2 AFLP引物筛选和作图群体标记基因型检测

4.3.3 SSR引物筛选和作图群体标记基因型检测

4.3.4标记基因型偏离孟德尔分离比例检测

4.3.5遗传连锁图谱的构建

4.3.6 小结

附录

4.4 陆地棉纤维相关性状的QTL分析

4.4.1 QTL似然比统计阈值确定

4.4.2区间作图QTL分析

4.4.3复合区间作图QTL分析

4.4.4多区间多作图QTL分析

4.4.5选择性基因型群体QTL分析1

4.4.5选择性基因型群体QTL分析2

4.4.6不同分析方法QTL定位结果比较

4.4.7小结

第5章讨论

5.1 作图群体亲本的特点

5.1.1作图群体亲本的亲缘关系与性状差异

5.1.2作图群体亲本之间的分子标记多态性

5.2 SSR标记产生多位点的现象

5.3 棉花遗传连锁图谱的饱和度

5.3.1异源四倍体陆海种间杂交群体遗传连锁图谱

5.3.2陆地棉种内杂交群体遗传连锁图谱

5.4 纤维相关性状QTL的特点

5.4.1 QTL的效应与来源

5.4.2 QTL的作用方式

5.4.3 QTL在染色体(连锁群)上的分布

5.5选择性基因型群体QTL定位

5.6常用QTL定位方法的优缺点

5.7 QTL定位的可靠性

5.8利用常规分离群体进行QTL定位存在的问题

5.9提高QTL定位灵敏度和精确度的方法

第6章结论

参考文献

附录1部分英文缩写

致谢

发表论文及参加课题一览表