干扰素诱导跨膜蛋白3基因多态性与HBV感染的结局相关性研究

摘要

目的：通过分析干扰素诱导跨膜蛋白3(Interferon-induced Transmembrane Protein 3，IFITM3)基因rs12252位点C/T多态性的分布特点,初步探讨IFITM3基因多态性与乙型肝炎病毒感染易感性的相关性，探索IFITM3rs12252不同基因型与HBV相关肝硬化及HBV相关肝癌的关联性，揭示影响乙型肝炎病毒致病性的宿主遗传因素。　　方法：(1)收集暨南大学第二临床医学院(深圳市人民医院)感染病科、介入科和肝胆外科2018年1月至2019年12月符合要求的门诊及住院病人的血清标本共159例，其中HBV相关肝病130例(乙肝组)，包括HBV相关肝癌组(肝癌组)68例、HBV相关肝硬化组(肝硬化组)30例、HBV感染非肝硬化组(非肝硬化组)32例,非HBV感染组(对照组)29例，均为汉族人群，主要来自中国南方。采集的外周全血于-80℃冰箱保存，用于提取人基因组DNA。(2)收集入组标本谷丙转氨酶、谷草转氨酶、谷氨酰转肽酶、碱性磷酸酶、白蛋白、总胆红素、凝血酶原时间、凝血酶原活动度、甲胎蛋白、HBVDNA、HBeAg等临床实验室检查。(3)提取外周血DNA，扩增相应的目的片段并测序，检测IFITM3基因rs12252位点的单核苷酸多态性。(4)使用SPSS22.0软件分析结果。各组等位基因和基因型频率采用基因计数法；采用X2检验比较组间IFITM3rs12252基因型频率和等位基因频率的分布差异；采用拟合优度卡方检验分析对照组是否符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。P＜0.05为差异有统计学意义。　　结果：(1)对照组样本符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。(2)乙肝组(包括肝癌组、肝硬化组、非肝硬化组)和对照组IFITM3rs12252CC/CT/TT基因型和C/T等位基因频率比较差异无统计学意义，组间两两比较也均无显著性差异。(3)乙肝组与对照组以及组间两两比较，IFITM3基因rs12252位点的C显性遗传、C隐性遗传、C/T共显性遗传、T显性遗传及T隐性遗传等五种遗传模式的差异均无统计学意义。(4)肝硬化组与其他组比较，有IFITM3rs12252C等位基因的遗传模式的OR值均＞1。(5)肝癌组与其他组比较，有IFITM3rs12252T等位基因的遗传模式的OR值均＞1。(6)乙肝患者HBVDNA高载量组和低载量组IFITM3rs12252三种基因型的差异无统计学意义(X2=0.57，P=0.75)；HBeAg阳性组和HBeAg阴性组IFITM3rs12252三种基因型的差异无统计学意义(X2=0.26，P=0.88)。　　结论：(1)对照组样本符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律，具有群体代表性，符合对照组标准。(2)本研究暂未发现人类IFITM3基因rs12252位点的C/T多态性与HBV感染的易感性及HBV相关肝硬化、肝癌存在相关性。(3)本研究暂未发现人类IFITM3rs12252C/T等位基因与宿主调控HBV复制的活跃程度存在相关性。

目录

声明

第1章 前言

第2章 研究对象及方法

2.1研究对象

2.1.2临床资料

2.1.3研究对象的入组及排除标准

2.2研究方法

2.2.1实验技术

2.2.2实验所用仪器和试剂

2.2.3实验步骤

2.3统计学方法

第3章 研究结果

3.1 DNA质检结果

3.2 IFITM3 rs12252基因型测序结果

3.3四组一般情况

3.4 四组IFITM3 rs12252基因型构成

3.5对照组IFITM3 rs12252基因型Hardy-Weinberg遗传平衡检验

3.6 IFITM3 rs12252基因型分布频率比较

3.7 IFITM3 rs12252 C/T等位基因频率比较

3.8 IFITM3基因 rs12252 C显性遗传模式分析

3.9 IFITM3 基因 rs12252 C隐性遗传模式分析

3.10 IFITM3 基因 rs12252 C/T共显性遗传模式分析

3.11 IFITM3 rs12252 T/C等位基因频率比较

3.12 IFITM3基因 rs12252 T显性遗传模式分析

3.13 IFITM3 基因 rs12252 T隐性遗传模式分析

3.14 IFITM3 rs12252三种基因型与病毒学指标的关系

第4章 讨论

第5章 结论

参考文献

缩略词表（Abbreviations）

在学期间发表论文清单

致谢