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PDSS1/2在肝细胞癌中的表达及其预后分析

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1.前言

2.材料和方法

2.1.1材料

2.1.2方法

2.2.1材料

2.2.2 方法

2.3 第三部分:GSEA探索PDSS1/2在HCC发生发展中潜在的信号通路

3.实验结果

3.1 生物信息学数据库分析结果

3.1.1 UALCAN数据库分析PDSS1/2 mRNA在24种肿瘤组织中的表达情况

3.1.2 TCGA数据库分析PDSS1/2在肝细胞癌组织中的表达及其与临床病理参数和预后的相关性

3.1.3 ONCOMINE基因芯片数据库验证PDSS1/2 mRNA在HCC中的表达及其与HCC患者预后的相关性

3.2 肝细胞癌免疫组织化学实验分析结果

3.2.1 PDSS1在HCC组织中高表达,PDSS2在HCC中低表达

3.2.2 PDSS1/2 编码蛋白与临床病理参数之间的相关性分析

3.2.3 PDSS1/2编码蛋白与肝细胞癌患者总体生存时间之间的相关性分析

3.2.4 影响118例HCC患者OS的单变量和多变量的COX回归分析

3.2.5 联合PDSS1和PDSS2编码蛋白表达分析其对HCC患者OS的影响

3.3 GSEA探索PDSS1/2在肝细胞癌发生发展中潜在的信号通路

4.讨论

4.1 PDSS1在HCC中的表达及临床意义

4.2 PDSS2在HCC中的表达及临床意义

4.3 联合检测PDSS1和PDSS2对评估HCC患者的预后具有潜在的应用价值

5.结论

参考文献

附录

在校期间发表的论文

致谢

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摘要

目的:通过分析PDSS1/2表达与肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)患者预后的关系以及可能涉及的信号通路,探索PDSS1/2基因在HCC研究中的潜在价值。  方法:  1、采用生物信息学数据库UALCAN、TCGA、ONCOMINE分析PDSS1/2mRNA在HCC中的表达情况及其与HCC患者预后的相关性。  2、收集暨南大学附属第一医院2013年12月至2018年12月肝细胞癌患者完整的临床资料118例,免疫组织化学染色法检测PDSS1/2在HCC组织中表达,分析其表达水平与HCC患者预后的相关性。  3、基因富集分析探索PDSS1/2在HCC发生发展中潜在的信号通路。  结果:  1、(1)UALCAN数据分析结果表明:PDSS1mRNA在HCC、胃癌等多数肿瘤组织中高表达;PDSS2mRNA在HCC、直肠腺癌等多数肿瘤组织中低表达。(2)TCGA数据分析结果表明:PDSS1mRNA在HCC中高表达(P<0.001),其高表达与HCC患者较差的Grade、Stage、TNM分期以及较短的总生存期相关(P<0.05),与性别、年龄无关(P>0.05),是HCC患者不良预后的独立危险因素(P<0.01)。PDSS2mRNA在HCC中低表达,其低表达与HCC患者较差的Grade、Stage分期相关(P<0.05),与性别、年龄、TNM分期、总生存期无关(P>0.05)。(3)ONCOMINE芯片数据分析结果表明:PDSS1mRNA在HCC中高表达,其高表达与HCC患者总生存期缩短相关(P<0.05);PDSS2mRNA在HCC中表达无差异,其表达与HCC患者的总体生存时间无关(P>0.05)。  2、我院临床病例免疫组化染色结果表明PDSS1在HCC中表达上调(P<0.05),其表达上调与患者性别、年龄、Grade分级、TNM分期、肿瘤大小、肿瘤个数、肿瘤包膜等无关(P>0.05),与HCC患者总体生存缩短相关(P<0.05),是影响HCC预后的独立危险因素(P<0.05)。PDSS2在HCC中表达下调(P<0.05),其表达下调与患者性别、年龄、Grade分级、TNM分期、肿瘤大小、肿瘤个数、肿瘤包膜等无关(P>0.05),与HCC患者的总体生存时间无关(P>0.05),不是影响HCC预后的危险因素(P>0.05)。联合检测PDSS1和PDSS2对评估HCC患者的预后具有潜在的应用价值(P<0.01)。  3、基因富集分析结果表明:PDSS1高表达能促进细胞周期、癌症、结肠癌等信号通路,PDSS1低表达能抑制药物细胞色素P450、视黄醇等代谢信号通路。PDSS2高表达能促进丙酸酯代谢、淀粉和蔗糖代谢等信号通路;PDSS2低表达可以抑制氧化性磷酸化、核糖体等信号通路。  结论:  (1)PDSS1在HCC中高表达,PDSS2在HCC中低表达。  (2)HCC患者中PDSS1高表达提示预后不良,可作为HCC患者预后的潜在的分子标志物,而PDSS2表达与HCC患者的预后无关。  (3)联合检测PDSS1和PDSS2对评估HCC患者的预后可能具有潜在的应用价值。

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