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摘要
缩略词
第一章绪论
1．1．2胃内微生物功能
1．1．3胃内微生物的影响因素
1．2慢性胃炎
1．2．1慢性胃炎的种类
1．2．2慢性胃炎的发展
1．2．3慢性胃炎发病诱因
1．3Helicobacter pylori与胃微生物群
1．3．2Helicobacter pylori感染
1．3．3Helicobacterpylori对胃内微生物群落构成的影响
1．4Helicobacter pylori与慢性胃炎
1．4．1Helicobacter pylori与胃炎的发生和发展
1．4．2Helicobacter pylori引起胃炎的主要机制
1．5Helicobacter pylori的治疗现状
1．5．1药物治疗
1．5．2胃内微生物与Helicobacter pylori的治疗
1．6本课题立项依据及研究内容
第二章胃内微生物的高通量测序分析
2．1实验材料
2．1．1研究对象及分组
2．1．2研究对象纳入和排除标准
2．1．3实验试剂
2．2实验方法
2．2．1制定并填写知情同意书
2．2．2胃黏膜样本的取材和处理
2．2．316S rRNA基因高通量测序
2．2．4生物信息学分析
2．3实验结果与分析
2．3．1研究对象的人口学数据及临床资料
2．3．2慢性非萎缩性胃炎组测序数据分析
2．3．3慢性萎缩性胃炎组测序数据分析
2．3．4健康对照组测序数据分析
2．3．5慢性胃炎组和健康对照组胃内微生物群落构成比对分析
2．3．6PICRUSt2功能预测分析
2．4本章小结
第三章胃内微生物的分离培养及与Helicobacter pylori相互作用菌株的筛选
3．1实验材料
3．1．1研究对象及分组
3．1．2培养基和实验试剂
3．2实验方法
3．2．1胃黏膜样品的取样和预处理
3．2．2样品稀释涂布培养及富集培养
3．2．3细菌的分离纯化
3．2．4菌株16S rRNA序列的PCR鉴定
3．2．5Helicobacter pylori共培养菌株的筛选
3．2．6筛选菌株与Helicobacter pylori共培养
3．3实验结果与分析
3．3．1可培养细菌的多样性分析
3．3．2可培养细菌与Helicobacter pyiori的固体平板共培养
3．3．3Helicobacter pylori拮抗菌株与Helicobacter pylori共培养的形态学观察
3．4本章小结
第四章Helicobacter pylori拮抗菌的基因组分析
4．2实验方法
4．2．1拮抗菌的基因组测序
4．2．2拮抗菌的基因组分析
4．3实验结果与分析
4．3．1基因组基本特征
4．3．2GO注释统计
4．3．3COG数据库注释
4．3．4KEGG通路分析
4．3．5耐药基因预测
4．3．6毒力基因检测
4．3．7病原菌与宿主互作分析
4．3．8次级代谢产物合成分析
4．4讨论
4．5本章小结
第五章总结与展望
5．2展望
参考文献
附录
致谢
资助情况
攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录
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